Servicios al investigador y empresas

Plataforma de Genómica

Servicios disponibles en la Plataforma de Genómica

Sometidas a rigurosos controles de calidad para favorecer el resultado biológico correspondiente a cada aplicación o experimento.

Protocolos para RNA-seq: recomendación de uso de la aplicación y ventajas
Stranded Full-length RNAseq mRNA prep

Análisis de transcriptoma completo de ARN polyA + con información de orientación de la hebra

  • Análisis den de la hebra.
  • Cobertura uARN polyA + codificantes y no codificantes con medición de la orientacióniforme y descubrimiento de características de alta confianza (por ejemplo, transcripciones alternativas, fusiones de genes, expresión específica de alelos, variantes de splicing).
Stranded Full-length RNAseq total prep with ribo-zero plus

Análisis de transcriptoma completo de ARN totales con información de orientación de hebra

  • Sensibilidad y fiabilidad para material low input.
  • Se puede tolerar cierto nivel de degradación del ARN (por ejemplo, muestras FFPE).
  • Análisis de ARN codificantes y no codificantes con medición de la orientación de la hebra.
  • Cobertura uniforme y descubrimiento de características de alta confianza (por ejemplo, transcripciones alternativas, fusiones de genes, expresión específica de alelos, variantes de splicing).
Stranded Full-length RNAseq total prep with ribo-depletion (low/ultra-low input)

Análisis de transcriptoma completo de ARN totales con información de orientación de hebra

  • Sensibilidad y fiabilidad para material low/ultra-low input (250 pg – 10ng, >1500 celulas).
  • Uso de identificadores moleculares únicos (UMI).
  • Se puede tolerar cierto nivel de degradación del ARN.
  • Análisis de ARN codificantes y no codificantes con medición de la orientación de la hebra.
  • Cobertura uniforme y descubrimiento de características de alta confianza (por ejemplo, transcripciones alternativas, fusiones de genes, expresión específica de alelos, variantes de splicing).
Small RNAseq

Análisis de transcriptoma de ARN pequeños (15-150 nt)

  • Análisis de ARN pequeños (miRNAs, siRNAs, piRNAs, snoRNAs)
  • Sensibilidad y fiabilidad para material low input (total RNA o enriched small RNA, 1 ng–2 μg).
Protocolos para DNA-seq: recomendación de uso de la aplicación
Whole Exome Sequencing (WES)

Detección de variantes genéticas relacionadas con enfermedad o fenotipo en la región codificante del genoma humano (hWES) o de ratón (mWES)

  • Profundidad: se ofrece una profundidad estándar de 100X, con posibilidad de aumentar o disminuir según la preferencia del usuario.
Whole Genome Sequencing (WGS)

Detección de variantes genéticas relacionadas con enfermedad o fenotipo en regiones codificantes y no codificantes del genoma humano (hWGS) o de ratón (mWGS)

  • Profundidad: se ofrece una profundidad estándar de 30X, con posibilidad de aumentar o disminuir según la preferencia del usuario.  
Ultra-low-pass whole-genome sequencing (ULP-WGS)

Detección de copy number alterations (CNA) y estimación de la fracción tumoral con un bajo coste de secuenciación. 

  • Profundidad: se ofrece una profundidad estándar de <0.5X, con posibilidad de aumentar o disminuir según la preferencia del usuario.  
DNAseq

Conversión de ADN obtenido desde una amplia gama de procedimientos, por ejemplo: procedimientos de tipo ChIP, amplicones, biblioteca de aptámeros, productos de PCR, en librerías de alta calidad para NGS.  

La plataforma de Genómica permite secuenciar librerías de cualquier tipo preparadas y cuantificadas por el usuario. Contactar con ngs_cima@unav.es para acordar el tipo de secuenciación, tiempos y precios.

¿Necesita ayuda?

Si tiene preguntas o dudas sobre sus muestras, contáctenos.

Innovación tecnológica de servicio

En la Plataforma de Genómica actualmente estamos en la última fase de desarrollo de nuevas técnicas más sensibles y complementarias a las que ofrecemos.

Contacte con nosotros para conocer si nuestra tecnología de preparación de librerías o de secuenciación. 

¿Cómo enviar un trabajo a la Plataforma de Genómica?

PASO 1: Presupuesto y consultas

Para solicitar un presupuesto, discutir el proyecto, consultas o más información sobre nuestros servicios, pueden contactar con nosotros enviando un correo electrónico a ngs_cima@unav.es.

PASO 2: Pedido

Descargar las recomendaciones para la preparación de las muestras y el formulario de pedido. Rellenar y enviar el documento a ngs_cima@unav.es.

PASO 3: Recepción de muestras

Entregar las muestras en el laboratorio 1.41-1.43 (Edificio CIMA, planta 1).

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•    Si desea que los datos de secuenciación sean analizados por la Plataforma de Bioinformática del Cima, deberán contactar también con Mikel Hernáez.