PLATAFORMA

Bioinformática

"Nuestro objetivo es la innovación tecnológica que se realiza en el marco de proyectos nacionales e internacionales".

DR. MIKEL HERNÁEZ ARRAZOLA
DIRECTOR. PLATAFORMA BIOINFORMÁTICA

La plataforma de Bioinformática tiene como objetivo el contribuir al desarrollo de los proyectos de investigación que se llevan a cabo en el Cima. Para ello se ofrece un apoyo completo en el desarrollo de cualquier experimento en el que se estudie el ADN o ARN a escala masiva tanto de humanos como de otros organismos.

La bioinformática permite, con datos provenientes de la experimentación en proteómica, el desarrollo de nuevas aplicaciones, como son la identificación de biomarcadores o de nuevas dianas terapéuticas para el desarrollo de medicamentos.

Las necesidades computacionales a las que hace frente la bioinformática han surgido principalmente debido a la gestión de grandes cantidades de información, el procesado de imagen y de espectros y la búsqueda en bases de datos.

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Una plataforma al servicio del paciente y la investigación

Diseño experimental

Asesoramiento para decidir el tamaño muestral, el diseño del estudio y la planificación de la metodología.

Análisis de datos

Procesado bioinformático de los datos obtenidos en diversas plataformas tecnológicas de alto rendimiento.

Interpretación de resultados

Una vez seleccionados los genes de interés se realizan estudios de asignación biológica-funcional.

Servicios de Bioinformática

  • Expresión diferencial de genes, miARNs o lncARNs. La tecnología de procedencia de los experimentos puede ser microarrays (Affymetrix, Agilent), PCRs masivas (TLDAs de Applied Biosystem) o RNA-seq (Illumina, Ion Torrent).
  • Estudios de genotipado y de variación del número de copias del ADN mediante microarrays (Affymetrix) o secuenciación del ADN (Illumina).
  • Caracterización de splicing alternativo a partir de los datos obtenidos en experimentos de microarrays (Affymetrix) o ARN-seq (Illumina).
  • Interacciones proteína-ADN a partir de experimentos de inmuprecipitación y microarrays (ChIP-chip) o secuenciación (ChIP-seq).
  • Patrones de metilación de ADN en experimentos con microarrays (Illumina Infinium).

Conozca al equipo investigador