Sobreexpresión de YRNAs y posibles implicaciones en la alergia

Antecedentes: Los pequeños ARN no codificantes (ARNsn) desarrollan importantes funciones relacionadas con la regulación epigenética. Los YRNAs son snRNAs implicados en el inicio de la replicación del ADN y en la estabilidad del ARN que regula la expresión génica. Se han relacionado con enfermedades autoinmunes, oncológicas e inflamatorias, pero nunca antes con la alergia. En este trabajo describimos por primera vez en pacientes alérgicos el perfil de expresión diferencial de los YRNAs, sus mecanismos de regulación y su potencial como nuevas dianas diagnósticas y terapéuticas.

Métodos: A partir de un estudio previo de RNAseq completo en células B de pacientes alérgicos, se obtuvieron perfiles de expresión diferencial de transcritos codificantes y no codificantes. Para seleccionar los transcritos no codificantes más expresados diferencialmente, se analizaron el cambio de pliegue y los valores p. Se desarrolló una validación de las diferencias de expresión detectadas en una cohorte independiente de 304 individuos, 208 pacientes alérgicos y 96 controles mediante qPCR. La capacidad potencial de unión y retrotransponibilidad se caracterizó mediante análisis estructural in silico. Mediante un novedoso enfoque bioinformático, se llevó a cabo la identificación de dianas de ARN, el enriquecimiento funcional y el análisis de redes.

Resultados: Encontramos que casi el 70% de los transcritos no codificantes sobreexpresados en pacientes alérgicos correspondían a YRNAs. De los tres candidatos más sobreexpresados diferencialmente, se confirmó de forma independiente una mayor expresión en la sangre periférica de los pacientes alérgicos. El análisis estructural sugirió una disminución de la capacidad de unión a proteínas y un aumento de la retrotransponibilidad. Los estudios de las dianas de ARN permitieron identificar secuencias relacionadas con los mecanismos inmunitarios subyacentes a la alergia.

Conclusiones: Se observa por primera vez la sobreexpresión de YRNAs en pacientes alérgicos. La información estructural y funcional apunta a su implicación en los mecanismos reguladores de la enfermedad.

CITA DEL ARTÍCULO  World Allergy Organ J. 2019 Jul 26;12(8):100047. doi: 10.1016/j.waojou.2019.100047. eCollection 2019 Aug.