Servicios al investigador y empresas

Plataforma de Genómica

Servicios disponibles en la Plataforma de Genómica

Sometidas a rigurosos controles de calidad para favorecer el resultado biológico correspondiente a cada aplicación o experimento.

Protocolos para RNA-seq: recomendación de uso de la aplicación y ventajas
3'UTR RNAseq

Análisis de expresión génica global de ARN polyA +. Solo recomendado para muestras low/ultra-low input

  • Sensibilidad y fiabilidad para material low input.
  • Se puede tolerar cierto nivel de degradación del ARN.
  • Uso de identificadores moleculares únicos (UMI).
  • Bajos costes de secuenciación.
Full-length RNA-seq

Análisis del transcriptoma completo de ARN polyA +. Solo recomendado para muestras low/ultra-low input

  • Sensibilidad y fiabilidad para material low input.
  • obertura uniforme y descubrimiento de características de alta confianza (por ejemplo, transcripciones alternativas, fusiones de genes, expresión específica de alelos, variantes de splicing).
Stranded Full-length RNAseq mRNA prep

Análisis de transcriptoma completo de ARN polyA + con información de orientación de la hebra

  • Análisis de ARN polyA + codificantes y no codificantes con medición de la orientación de la hebra.
  • Cobertura uniforme y descubrimiento de características de alta confianza (por ejemplo, transcripciones alternativas, fusiones de genes, expresión específica de alelos, variantes de splicing).
Stranded Full-length RNAseq total prep

Análisis de transcriptoma completo de ARN totales con información de orientación de hebra

  • Sensibilidad y fiabilidad para material low input.
  • Se puede tolerar cierto nivel de degradación del ARN (por ejemplo, muestras FFPE).
  • Análisis de ARN codificantes y no codificantes con medición de la orientación de la hebra.
  • Cobertura uniforme y descubrimiento de características de alta confianza (por ejemplo, transcripciones alternativas, fusiones de genes, expresión específica de alelos, variantes de splicing).
Protocolos para DNA-seq: recomendación de uso de la aplicación
Whole Exome Sequencing (WES)

Detección de variantes genéticas relacionadas con enfermedad o fenotipo en la región codificante del genoma humano.

  • Profundidad: se ofrece una profundidad estándar de 30X, 50X o 100X, con posibilidad de aumentar o disminuir según la preferencia del usuario.
Whole Genome Sequencing (WGS)

Detección de variantes genéticas relacionadas con enfermedad o fenotipo en regiones codificantes y no codificantes.

  • Profundidad: se ofrece una profundidad estándar de 30X o 40X (genoma humano y ratón), con posibilidad de aumentar o disminuir según la preferencia del usuario.  

Conversión de ADN obtenido desde una amplia gama de procedimientos (por ejemplo: procedimientos de tipo ChIP, amplicones, biblioteca de aptámeros, productos PCR) en librerías de alta calidad para NGS.

Ejemplos de tipos de librerías aceptadas

La plataforma de Genómica permite secuenciar librerías de cualquier tipo (compatibles con plataformas Illumina) preparadas y cuantificadas por el usuario. En este caso, la plataforma no puede garantizar la calidad o cantidad de los datos finales.

Ejemplos de tipos de librerías aceptadas:

  • scRNAseq
  • MARSseq
  • Exomas
  • ChIP-seq
  • ATAC-seq

¿Necesita ayuda?

Si tiene preguntas o dudas sobre sus muestras, contáctenos.

Innovación tecnológica de servicio

En la Plataforma de Genómica actualmente estamos en la última fase de desarrollo de nuevas técnicas más sensibles y complementarias a las que ofrecemos.

Contacte con nosotros para conocer si nuestra tecnología de preparación de librerías o de secuenciación. 

¿Cómo enviar un trabajo a la Plataforma de Genómica?

PASO 1: Presupuesto y consultas

Para solicitar un presupuesto, discutir el proyecto, consultas o más información sobre nuestros servicios, pueden contactar con nosotros enviando un correo electrónico a ngs_cima@unav.es.

PASO 2: Pedido

Rellenar el formulario de pedido y el sample datasheet. Enviar los documentos a ngs_cima@unav.es.

PASO 3: Recepción de muestras

Entregar las muestras en el laboratorio 1.41 (Edificio CIMA), en el horario de 12.00 a13.00 y 16.00 a 17.00 horas.

  • RNA: Normalizar la concentración de RNA de todas las muestras a 10 ng/uL en un volumen de 30 uL de buffer 10 mM TRIS pH 7.5 o buffer TE.
  • DNA: Normalizar la concentración de DNA de todas las muestras a 50 ng/uL en un volumen de 20 uL de buffer 10 mM TRIS pH 8 o buffer TE.

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•    Si desea que los datos de secuenciación sean analizados por la Plataforma de Bioinformática del Cima, deberán contactar también con Mikel Hernáez.